Inazuma Eleven Ares prende atto in una linea temporale alternativa ambientata dopo gli eventi della prima stagione della serie originale: l'attacco "alieno" infatti non è avvenuto e la Raimon, dopo esser stata consacrata la squadra giovanile più forte del Giappone, deve prepararsi ad affrontare il suo prossimo avversario, il mondo.
